2020
かいめいKM20-10（西七島海嶺、中マリアナ海嶺・西マリアナ海嶺北部） 11月25日（横須賀）〜12月12日（二見）
かいめいKM20-08（相模湾、伊豆小笠原諸島東方） 10月25日（横須賀）〜11月11日（横須賀）
2019
よこすかYK19-11（伊豆・小笠原） 8月28日（二見）〜9月14日（横須賀）
2018
よこすかYK18-E02C（磐城海山） 10月15日（横須賀）〜28日（横須賀） [しんかい６５００ レポート]；[記者説明会]
かいめいKM18-07C Leg. 2（沖縄トラフ） 8月17日（那覇）〜26日（横須賀）
新青丸KS18-3（伊豆・小笠原） 4月3日（横須賀）〜6日（横須賀）
2017
かいめいKM17-12C（沖縄トラフ） 11月13日（横須賀）〜29日（横須賀）
新青丸KS17-7（三陸沖） 8月7日（石巻）〜12日（石巻） ＊主席航海
みらいMR17-03C（沖縄トラフ） 5月29日（中城）〜6月13日（関根浜）
2016
かいれいKR16-15（沖縄トラフ） 11月9日（那覇）〜16日（那覇）
かいれいKR16-12（伊豆・小笠原） 9月27日（横須賀）〜10月4日（横須賀）
よこすかYK16-11 Leg. 2（琉球海溝） 8月30日（石垣）〜9月6日（那覇） [しんかい６５００ レポート]
新青丸KS16-11（三陸沖） 8月15日（横須賀）～18日（横須賀） ＊初主席航海
白嶺第2次航海 5月13日（船橋）〜6月6日（船橋）
かいれいKR16-03（沖縄トラフ） 2月10日（横須賀）～18日（横須賀）
2015
かいれいKR15-17（沖縄トラフ） 11月9日（那覇）～15日（那覇）
かいれいKR15-16（沖縄トラフ） 10月26日（那覇）～11月7日（那覇）
かいれいKR15-01（小笠原海溝） 3月13日（横須賀）～19日（横須賀）
新青丸KS15-01（三陸沖） 3月5日（横須賀）～10日（晴海）
2014
新青丸KS14-14（三陸沖） 8月9日（函館）～15日（塩釜）
よこすかYK14-12（三陸沖深海平原） 6月28日（横須賀）～7月4日（横須賀） [しんかい６５００ レポート]
白鳳丸KH14-02（北西太平洋） 5月20日（晴海）～6月11日（大井）
よこすかYK14-06（三陸沖深海平原） 5月2日（晴海）～8日（横須賀） [しんかい６５００ レポート]
なつしまNT14-06（ベヨネース海丘） 4月11日（横須賀）～20日（清水）
新青丸KS14-02 Leg. 2 （三陸沖） 3月15日（石巻）～19日（八戸）
2013
新青丸KS13-01（三陸沖） 12月8日（横須賀）～16日（晴海） ＊新青丸による最初の研究航 [研究トピックス]
新青丸KS13-T2（鹿島沖、相模湾） 10月12日（横須賀）～17日（晴海）
第三開洋丸KK13-06（三陸沖） 9月14日（塩釜）～21日（塩釜）
第三開洋丸KK13-03（三陸沖） 8月22日（塩釜）～27日（三崎）
第三開洋丸KK13-01 Leg. 1（三陸沖） 6月24日（塩釜）～29日（塩釜）
淡青丸KT13-02（三陸沖） 1月19日（塩釜）～25日（台場） ＊淡青丸による最後の研究航海 [プレスリリース]
2012
淡青丸KT12-20（三陸沖） 8月7日（八戸）～12日（塩釜）
淡青丸KT12-18（三陸沖） 7月20日（塩釜）～27日（八戸）
よこすかYK12-09（房総沖・三重会合点） 6月14日（横須賀）～21日（横須賀）
淡青丸KT12-10（福島沖・三陸沖） 5月11日（塩釜）～18日（台場）
淡青丸KT12-08（三陸沖） 4月28日（台場）～5月3日（塩釜）
淡青丸KT12-04（駿河湾沖） 4月2日（台場）～7日（清水）
淡青丸KT12-01（三陸沖・相模湾） 3月4日（台場）～9日（台場）
2011
よこすかドック回航（小笠原海溝） 12月22日（横須賀）～26日（神戸）
かいれいKR11-11（小笠原海溝） 12月8日（横須賀）～15日（横須賀）
白鳳丸KH11-09 Leg. 3（南海トラフ） 11月5日（晴海）～23日（清水）
淡青丸KT11-17（三陸沖） 7月29日（台場）～8月5日（八戸） => 三陸沖で海底の撹乱を確認しました [プレスリリース]
淡青丸KT11-12（宮崎沖・高知沖） 6月22日（鹿児島）～6月28日（神戸）
淡青丸KT11-08（網走沖） 5月17日（函館）～24日（小樽）
2010
淡青丸KT10-23（琉球海溝） 10月15日（那覇）～21日（那覇）
淡青丸KT10-08（日本海） 5月20日（富山）～29日（釧路）
2009
淡青丸KT09-07（千島海溝） 5月20日（塩釜）～28日（八戸）
2008
淡青丸KT08-30（熊野灘・遠州灘） 11月13日（台場）～17日（鹿児島）
なつしまNT08-07 Leg. 2（明神海丘） 4月3日（横須賀）～17日（清水）